გარემოსდაცვითი ზედამხედველობის დეპარტამენტის ძირითადი ფუნქცია გარემოს დაცვისა და ბუნებრივი რესურსებით სარგებლობის სფეროში სახელმწიფო კონტროლის განხორციელებაა. ასევე, ბუნებრივი რესურსებით უკანონო სარგებლობის და გარემოს დაბინძურების ფაქტების პრევენცია, მათი გამოვლენა და აღკვეთაა.